![Dyfyr Jones](https://profiles-cardiff.imgix.net/attachments/1494?w=200&h=200&auto=format&crop=faces&fit=crop&q=90")
Dr Dyfyr Jones
Darlithydd mewn Cemeg
- JonesD80@caerdydd.ac.uk
- +44 29208 74082
- Y Prif Adeilad, Plas y Parc, Caerdydd, CF10 3AT
- Siarad Cymraeg
- Ar gael fel goruchwyliwr ôl-raddedig
Trosolwyg
Rwy'n fferyllydd meddyginiaethol sy'n gweithio yn y Sefydliad Darganfod Meddyginiaethau (MDI) ac yn Ddarlithydd a noddir gan y Coleg Cymraeg Cenedlaethol yn yr adran gemeg. Yn dilyn hyfforddiant fel cemegydd synthetig, mae gen i ddiddordeb mewn nifer o feysydd sydd ar ffin cemeg a bioleg sydd â'r potensial i gael eu defnyddio i ddatblygu triniaethau newydd ar gyfer anghenion clinigol heb eu diwallu. Ar hyn o bryd rwy'n rhan o dîm amlddisgyblaethol sy'n gweithio ar opsiwn triniaeth bosibl ar gyfer Anhwylder Storio Lysosomal.
Mae gen i ddiddordeb mewn defnyddio cemeg synthetig ar y cyd ag egwyddorion cemeg feddyginiaethol i wella priodweddau moleciwlau bach o'r 'hits' cychwynnol i foleciwlau mwy addas y gellid eu defnyddio naill ai i ddilysu targedau/llwybrau biolegol neu eu cymryd ymhellach ymlaen yn y broses o ddarganfod cyffuriau. Wrth wella priodweddau'r moleciwlau bach hyn, rwy'n ceisio bod yn ymwybodol o lwybrau ymateb anarferol a allai fod yn ddefnyddiol yn eu rhinwedd eu hunain. Rwy'n cael fy swyno gan y dechnoleg gymharol newydd o ddefnyddio moleciwlau deuswyddogaethol, fel PROTACs ac mae gennyf ddiddordeb cynyddol mewn clefydau sy'n cael eu hachosi gan gamddatblygu proteinau.
Cemegwr meddyginiaethol ydw i sydd yn gweithio yn y Sefydliad Darganfod Meddyginiaethau (SDM); rwyf hefyd yn ddarlithydd yn yr adran gemeg dan nawdd y Coleg Cymraeg Cenedlaethol. Yn dilyn hyfforddiant fel cemegwr synthetig, rwyf wedi magu diddordeb mewn nifer o feysydd sydd yn bodoli ar y ffin rhwng cemeg a bioleg sydd â'r potensial i gael eu defnyddio i ddatblygu triniaethau newydd ar gyfer anghenion clinigol heb eu cwrdd. Ar hyn o bryd, rwyf yn rhan o dîm amlddisgyblaethol sy'n gweithio ar ddatblygu opsiwn o driniaeth bosib ar gyfer clefyd storio leisosomal.
Mae diddordeb gennyf mewn defnyddio cemeg synthetig mewn cyfuniad ag egwyddorion cemeg feddyginiaethol i wella priodweddau molecylau bychain dechreuol prosiect ymchwil i folecylau sydd yn fwy addas at gael eu defnyddio i wirio targedau/llwybrau biolegol neu a fydd yn cael eu dewis i fynd ymhellach ar hyd y broses darganfod meddyginiaethau. Wrth wella priodweddau'r molecylau bychain hyn, rwyf yn ceisio cadw golwg fanwl am adweithiau cemegol anarferol a allai fod yn ddefnyddiol. Rwyf yn gweld molecylau deuswyddogaethol, megis PROTACs, sydd yn dechnoleg eitha newydd, yn hynod o ddiddorol ac mae gennyf ddiddordeb cynyddol mewn afiechydon sy'n cael eu hachosi gan broteinau sydd wedi'u camblygu.
Cyhoeddiad
2023
- Thomas, B., Lewis, L., Jones, D. and Ward, S. 2023. Central nervous system targeted protein degraders. Biomolecules 13(8), article number: 1164. (10.3390/biom13081164)
- Davies, M., Riseley, R., Jones, D. H. and Waller-Evans, H. 2023. Acid ceramidase inhibition as a mechanism to treat lysosomal disorders. Molecular Genetics and Metabolism 138(2), article number: 107069. (10.1016/j.ymgme.2022.107069)
2022
- Collins, R. et al. 2022. Comparative analysis of small-molecule limk1/2 inhibitors: chemical synthesis, biochemistry, and cellular activity. Journal of Medicinal Chemistry (10.1021/acs.jmedchem.2c00751)
- Romartinez-Alonso, B. et al. 2022. Structure-guided approach to relieving transcriptional repression inResistance to Thyroid Hormone α. Molecular and Cellular Biology 42(2), article number: e00363-21. (10.1128/MCB.00363-21)
2020
- Fromont, C. et al. 2020. Discovery of highly selective inhibitors of calmodulin-dependent kinases that restore insulin sensitivity in the diet-induced obese in vivo mouse model. Journal of Medicinal Chemistry 63(13), pp. 6784-6801. (10.1021/acs.jmedchem.9b01803)
2019
- Radhi, O. A. et al. 2019. Inhibition of the ULK1 protein complex suppresses Staphylococcus-induced autophagy and cell death. Journal of Biological Chemistry 294(39), pp. 14289-14307. (10.1074/jbc.RA119.008923)
2018
- Pariollaud, M. et al. 2018. Circadian clock component REV-ERBα controls homeostatic regulation of pulmonary inflammation. Journal of Clinical Investigation 128(6), pp. 2281-2296. (10.1172/JCI93910)
- Frei, P., Jones, D. H., Kay, S. T., McLellan, J. A., Johnston, B. F., Kennedy, A. R. and Tomkinson, N. C. O. 2018. Regioselective reaction of heterocyclic N-oxides, an acyl chloride, and cyclic thioethers. Journal of Organic Chemistry 83(3), pp. 1510-1517. (10.1021/acs.joc.7b02457)
2017
- Jones, D. H., Kay, S. T., McLellan, J. A., Kennedy, A. R. and Tomkinson, N. C. O. 2017. Regioselective three-component reaction of pyridine N-oxides, acyl chlorides, and cyclic ethers. Organic Letters 19(13), pp. 3512-3515. (10.1021/acs.orglett.7b01481)
2016
- Jones, D. H., Tellam, J., Bresciani, S., Wojno-Picon, J., Cooper, A. and Tomkinson, N. 2016. Preparation of symmetrical and nonsymmetrical fluorene sulfonamide scaffolds. SYNLETT 28(5), pp. 577-582. (10.1055/s-0036-1588916)
- Saleh, B. A., Smith, K., Elliott, M. C., Jones, D. H., Kariuki, B. M. and El Hiti, G. A. 2016. Reactions of organoboranes with carbanions bearing three potential leaving groups: unusual processes, products and mechanisms. Tetrahedron 72(44), pp. 6914-6928. (10.1016/j.tet.2016.09.005)
- Dragan, A., Jones, D. H., Kennedy, A. R. and Tomkinson, N. C. O. 2016. Stereoselective synthesis of alkylidene phthalides. Organic Letters 18(13), pp. 3086-3089. (10.1021/acs.orglett.6b01203)
- Jones, D. H., Bresciani, S., Tellam, J. P., Wojno, J., Cooper, A. W. J., Kennedy, A. R. and Tomkinson, N. C. O. 2016. Synthesis of dibenzylamino-1-methylcyclohexanol and dibenzylamino-1-trifluoromethylcyclohexanol isomers. Organic and Biomolecular Chemistry 14(1), pp. 172-182. (10.1039/C5OB01924A)
2015
- Jones, D. H., Smith, K., Elliott, M. C. and El-Hiti, G. A. 2015. Factors affecting reactions of trialkylcyanoborates with imidoyl chlorides/trifluoroacetic anhydride. Tetrahedron 71(36), pp. 6285-6289. (10.1016/j.tet.2015.06.038)
2014
- El-Hiti, G. A., Smith, K., Hegazy, A. S., Jones, D. H. and Kariuki, B. 2014. 2-Ethyl-3-[(R)-2-phenylbutanamido]quinazolin-4(3H)-one monohydrate. Acta Crystallographica Section E - Structure Reports Online 70(4), article number: o467. (10.1107/S1600536814005996)
- Elliott, M. C. and Jones, D. H. 2014. [4 + 2] Cycloaddition as the key step. In: Muller, T. J. J. ed. Multicomponent Reactions 2. Reactions Involving an a,b-Unsaturated Carbonyl Compound as Electrophilic Component, Cycloadditions, and Boron-, Silicon-, Free-Radical-, and Metal-Mediated Reactions. Düsseldorf: Thieme, pp. 243-286.
2013
- El-Hiti, G. A., Smith, K., Elliott, M. C., Jones, D. H. and Kariuki, B. 2013. (E)-2-(1,1-Dicyclohexyl-3-phenylallyl)-5,5-dimethyl-1,3,2-dioxaborinane. Acta Crystallographica Section E - Structure Reports Online 69(9), article number: o1403. (10.1107/S1600536813021739)
- El-Hiti, G. A., Smith, K., Jones, D. H., Masmali, A. and Kariuki, B. M. 2013. (Z)-N-(2,6-Diisopropylphenyl)-4-nitrobenzimidoyl chloride. Acta Crystallographica Section E 69(9), article number: o1384. (10.1107/S1600536813020862)
- Jones, D. H. 2013. Approaches to quaternary carbon centres using organoboron chemistry. PhD Thesis, Cardiff University.
- Elliott, M. C., Smith, K., Jones, D. H., Hussain, A. and Saleh, B. A. 2013. Factors affecting migration of tertiary alkyl groups in reactions of alkylboronic esters with bromomethyllithium. The Journal of Organic Chemistry 78(7), pp. 3057-3064. (10.1021/jo4000459)
- Smith, K., Elliott, M. C. and Jones, D. H. 2013. 3-Chloro-1-lithiopropene - a functional organolithium reagent - and its reactions with alkylboronates to give 3-Alkylprop-1-en-3-ols. Journal of Organic Chemistry 78(18), pp. 9526-9531. (10.1021/jo4018028)
Adrannau llyfrau
- Elliott, M. C. and Jones, D. H. 2014. [4 + 2] Cycloaddition as the key step. In: Muller, T. J. J. ed. Multicomponent Reactions 2. Reactions Involving an a,b-Unsaturated Carbonyl Compound as Electrophilic Component, Cycloadditions, and Boron-, Silicon-, Free-Radical-, and Metal-Mediated Reactions. Düsseldorf: Thieme, pp. 243-286.
Erthyglau
- Thomas, B., Lewis, L., Jones, D. and Ward, S. 2023. Central nervous system targeted protein degraders. Biomolecules 13(8), article number: 1164. (10.3390/biom13081164)
- Davies, M., Riseley, R., Jones, D. H. and Waller-Evans, H. 2023. Acid ceramidase inhibition as a mechanism to treat lysosomal disorders. Molecular Genetics and Metabolism 138(2), article number: 107069. (10.1016/j.ymgme.2022.107069)
- Collins, R. et al. 2022. Comparative analysis of small-molecule limk1/2 inhibitors: chemical synthesis, biochemistry, and cellular activity. Journal of Medicinal Chemistry (10.1021/acs.jmedchem.2c00751)
- Romartinez-Alonso, B. et al. 2022. Structure-guided approach to relieving transcriptional repression inResistance to Thyroid Hormone α. Molecular and Cellular Biology 42(2), article number: e00363-21. (10.1128/MCB.00363-21)
- Fromont, C. et al. 2020. Discovery of highly selective inhibitors of calmodulin-dependent kinases that restore insulin sensitivity in the diet-induced obese in vivo mouse model. Journal of Medicinal Chemistry 63(13), pp. 6784-6801. (10.1021/acs.jmedchem.9b01803)
- Radhi, O. A. et al. 2019. Inhibition of the ULK1 protein complex suppresses Staphylococcus-induced autophagy and cell death. Journal of Biological Chemistry 294(39), pp. 14289-14307. (10.1074/jbc.RA119.008923)
- Pariollaud, M. et al. 2018. Circadian clock component REV-ERBα controls homeostatic regulation of pulmonary inflammation. Journal of Clinical Investigation 128(6), pp. 2281-2296. (10.1172/JCI93910)
- Frei, P., Jones, D. H., Kay, S. T., McLellan, J. A., Johnston, B. F., Kennedy, A. R. and Tomkinson, N. C. O. 2018. Regioselective reaction of heterocyclic N-oxides, an acyl chloride, and cyclic thioethers. Journal of Organic Chemistry 83(3), pp. 1510-1517. (10.1021/acs.joc.7b02457)
- Jones, D. H., Kay, S. T., McLellan, J. A., Kennedy, A. R. and Tomkinson, N. C. O. 2017. Regioselective three-component reaction of pyridine N-oxides, acyl chlorides, and cyclic ethers. Organic Letters 19(13), pp. 3512-3515. (10.1021/acs.orglett.7b01481)
- Jones, D. H., Tellam, J., Bresciani, S., Wojno-Picon, J., Cooper, A. and Tomkinson, N. 2016. Preparation of symmetrical and nonsymmetrical fluorene sulfonamide scaffolds. SYNLETT 28(5), pp. 577-582. (10.1055/s-0036-1588916)
- Saleh, B. A., Smith, K., Elliott, M. C., Jones, D. H., Kariuki, B. M. and El Hiti, G. A. 2016. Reactions of organoboranes with carbanions bearing three potential leaving groups: unusual processes, products and mechanisms. Tetrahedron 72(44), pp. 6914-6928. (10.1016/j.tet.2016.09.005)
- Dragan, A., Jones, D. H., Kennedy, A. R. and Tomkinson, N. C. O. 2016. Stereoselective synthesis of alkylidene phthalides. Organic Letters 18(13), pp. 3086-3089. (10.1021/acs.orglett.6b01203)
- Jones, D. H., Bresciani, S., Tellam, J. P., Wojno, J., Cooper, A. W. J., Kennedy, A. R. and Tomkinson, N. C. O. 2016. Synthesis of dibenzylamino-1-methylcyclohexanol and dibenzylamino-1-trifluoromethylcyclohexanol isomers. Organic and Biomolecular Chemistry 14(1), pp. 172-182. (10.1039/C5OB01924A)
- Jones, D. H., Smith, K., Elliott, M. C. and El-Hiti, G. A. 2015. Factors affecting reactions of trialkylcyanoborates with imidoyl chlorides/trifluoroacetic anhydride. Tetrahedron 71(36), pp. 6285-6289. (10.1016/j.tet.2015.06.038)
- El-Hiti, G. A., Smith, K., Hegazy, A. S., Jones, D. H. and Kariuki, B. 2014. 2-Ethyl-3-[(R)-2-phenylbutanamido]quinazolin-4(3H)-one monohydrate. Acta Crystallographica Section E - Structure Reports Online 70(4), article number: o467. (10.1107/S1600536814005996)
- El-Hiti, G. A., Smith, K., Elliott, M. C., Jones, D. H. and Kariuki, B. 2013. (E)-2-(1,1-Dicyclohexyl-3-phenylallyl)-5,5-dimethyl-1,3,2-dioxaborinane. Acta Crystallographica Section E - Structure Reports Online 69(9), article number: o1403. (10.1107/S1600536813021739)
- El-Hiti, G. A., Smith, K., Jones, D. H., Masmali, A. and Kariuki, B. M. 2013. (Z)-N-(2,6-Diisopropylphenyl)-4-nitrobenzimidoyl chloride. Acta Crystallographica Section E 69(9), article number: o1384. (10.1107/S1600536813020862)
- Elliott, M. C., Smith, K., Jones, D. H., Hussain, A. and Saleh, B. A. 2013. Factors affecting migration of tertiary alkyl groups in reactions of alkylboronic esters with bromomethyllithium. The Journal of Organic Chemistry 78(7), pp. 3057-3064. (10.1021/jo4000459)
- Smith, K., Elliott, M. C. and Jones, D. H. 2013. 3-Chloro-1-lithiopropene - a functional organolithium reagent - and its reactions with alkylboronates to give 3-Alkylprop-1-en-3-ols. Journal of Organic Chemistry 78(18), pp. 9526-9531. (10.1021/jo4018028)
Gosodiad
- Jones, D. H. 2013. Approaches to quaternary carbon centres using organoboron chemistry. PhD Thesis, Cardiff University.
Ymchwil
Current and past projects that I am/have been involved in within the MDI:
- Investigation of GABA receptor subtype-selective small molecules as a potential treatment for the cognitive impairment that accompanies Huntington’s disease (funded by the Wellcome Trust).
- Research into a small molecule target that may deliver a treatment option for Fragile X Syndrome (funded by the MRC).
- A Coleg Cymraeg Cenedlaethol (CCC)-funded project to look at an innovative method of treatment for prion diseases.
- A Cardiff University seedcorn-funded proof of concept project to research whether activation of a lysosomal target could be used as an alternative treatment for prion diseases.
- Lead chemist on a project aiming to develop a treatment for a Lysosomal Storage Disorder.
Prosiectau rwyf yn/wedi bod yn ymwneud â hwy o fewn y SDM:
- Ymchwil i mewn i folecylau bychain sydd â detholusrwydd ar draws is-fathau o dderbynyddion GABA ar gyfer triniaeth bosib i ddirywiad deallusol sydd yn gysylltuedig â chlefyd Huntington (ariannwyd gan y Wellcome Trust).
- Ymchwil i mewn i darged molecylau bychain a allai olygu opsiwn am driniaeth i Syndrom Fragile X (ariannwyd gan yr MRC).
- Prosiect wedi’i ariannu gan y Coleg Cymraeg Cenedlaethol (CCC) i edrych ar ddull arloesol o drin afiechydon prion.
- Prosiect wedi’i ariannu gan Brifysgol Caerdydd i ymchwilio a allai actifeiddio targed leisosomal arwain at driniaeth amgen ar gyfer afiechydon prion.
- Prif gemegydd ar brosiect i geisio datblygu triniaeth ar gyfer Clefyd Storio Leisosomal.
Addysgu
Darlithydd ar y cyrsiau canlynol:
CH5103 - Sylfeini Cemeg Organig
CH5108 - Cyflwyniad i Gemeg y Brifysgol
CH5110 - Sylfaen Cemeg Blwyddyn 1 Ymarferol
Rwy'n cyfrannu at y cyrsiau canlynol:
CH5203 - Cemeg Organig a Biolegol Bellach
CH5206 - Cyfathrebu Cemeg: Sgiliau allweddol ar gyfer cemegwyr
CH5207 - Cyflwyniad i gemeg bywyd
CH3325 - Prosiect blwyddyn olaf
CH3401 - Prosiect blwyddyn olaf
Darlithydd ar gyfer:
CH5103 - Cemeg Organig Sylfaenol
CH5108 - Cyflwyniad i Gemeg y Brifysgol
CH5110 - Sylfaen Cemeg Blwyddyn 1 Ymarferol
Rwy'n cymryd rhan yn y modiwlau canlynol:
CH5203 - Cemeg organig a phibellhach biolegol
CH5206 - Cyfathrebu Cemeg: Sgiliau hanfodol i cemegwyr
CH5207 - Cyflwyniad i cemeg bywyd
CH3325 - Prosiect blwyddyn olaf
CH3401 - Prosiect blwyddyn olaf
Bywgraffiad
Cynhaliwyd fy astudiaethau israddedig (MChem) ym Mhrifysgol Caerdydd. Ynghyd â'm prosiect blwyddyn olaf ar gynhyrchu canolfannau carbon cwaternaidd gan ddefnyddio cemeg organoboron newydd (Yr Athro Keith Smith), cefais y cyfle gan Raglen Cyfleoedd Ymchwil Israddedigion Caerdydd (CUROP) i weithio ar synthesis dorsomorffin (Yr Athro Mark Bagley). Fe wnes i barhau â'm hymchwil dan oruchwyliaeth yr Athro Keith Smith mewn cydweithrediad â Dr Mark Elliot ym Mhrifysgol Caerdydd, gan weithio ar yr adweithiau cyanidation, DCME, 1-lithio-3-chloropropene a phromomethyl lithiwm organoboron. Ar ôl cwblhau'r PhD, treuliais ychydig dros dair blynedd ym Mhrifysgol Strathclyde gyda grŵp ymchwil yr Athro Nick Tomkinson, yn gweithio ar ddau brif brosiect: modiwleiddio moleciwl bach derbynyddion niwclear REV-ERBα / RORα a hyrwyddodd moleciwl bach amlhau celloedd cynhenid yr afu (canolbwynt bôn-gelloedd y DU). Roeddwn hefyd yn ymwneud â nifer o brosiectau cemeg meddyginiaethol a chemeg organig ychwanegol. Yn 2016, symudais i Brifysgol Manceinion i weithio gyda Dr Sam Butterworth ar brosiect darganfod cyffuriau aml-gydweithredol, i ddatblygu atalyddion newydd y kinases sy'n ddibynnol ar calmodulin. Yn dilyn hyn, dechreuais fy swydd bresennol yn y Sefydliad Darganfod Meddyginiaethau (MDI) newydd ei ffurfio ym Mhrifysgol Caerdydd yn 2018, lle rwyf wedi bod yn gweithio ar sawl targed darganfod cyffuriau CNS.
Cyflewnais fy astudiaethau israddedig (MChem) ym Mhrifysgol Caerdydd. Yn ogystal â fy mhrosiect blwyddyn olaf ar greu atomau carbon cwaternaidd gan ddefnyddio cemeg organoboron (yr Athro Keith Smith), cefais y cyfle gan Raglen Cyfleoedd Ymchwil Israddedig Caerdydd (CUROP) i weithio ar syntheseiddio dorsomorphin (yr Athro Mark Bagley). Parheais fy ymchwil dan oruchwyliad yr Athro Keith Smith gan gydweithio â Dr Mark Elliot ym Mhrifysgol Caerdydd, drwy weithio ar yr adweithiau organoboron cyanideiddio, DCME, 1-lithio-3-cloropropin a bromomethyl lithiwm. Yn dilyn cwblhad y ddoethuriaeth, treuliais fymryn dros dair blynedd ym Mhrifysgol Ystrad Clud gyda grŵp ymchwil yr Athro Nick Tomkinson yn gweithio ar ddau brif brosiect: modiwleiddio derbynyddion niwclear REV-ERBα/RORα a hybu tyfiant celloedd bôn yr afu drwy ddefnyddio molecylau bychain (hwb celloedd bôn y DU). Yn ogystal, roeddwn yn rhan o sawl prosiect cemeg organig a chemeg feddyginiaethol ychwanegol. Yn 2016, symudais i Brifysgol Manceinion i weithio gyda Dr Sam Butterworth ar brosiect darganfod meddyginiaethau aml-i ddatblygu atalyddion nofel i'r cinasau sy'n ddibynnol ar galmodwlin. Yn dilyn hyn, dechreuais fy swydd gyfredol yn y Sefydliad Darganfod Meddyginiaethau (SDM) ym Mhrifysgol Caerdydd yn 2018, lle rwyf wedi bod yn gweithio ar sawl targed ymchwil darganfod feddyginiaethol o fewn y System Nerfol Ganolog (SNG).
Meysydd goruchwyliaeth
Mae'r swydd ar gael ar hyn o bryd ar gyfer interniaeth haf ar:
Cael gwared ar lefelau gwenwynig o Zn2 +; Triniaeth bosibl ar gyfer Anhwylderau Storio Lysosomaidd
Safle ar gael dros yr hâf:
Gwaredu ar lefelau tocsig o Zn2+; therapi arloesol ar gyfer Clefydau Storio Lysosomal